Sorge in una zona litoranea pianeggiante, posta a 3 metri sopra il livello del mare.

Posta al centro della costa orientale dell'isola di Salina, Santa Marina Salina prende il nome dalla chiesa di Santa Marina della Bitinia ubicata vicino alla salina più grande delle isole Eolie.

Fu frazione del comune di Salina fino al 1909, anno in cui divenne comune autonomo.

Non ci sono pervenute molte notizie storiche del comune. Sono comunque presenti resti di costruzioni romane e delle iscrizioni di età imperiale.

Nel 1648 venne istituito il marchesato in favore di Giuseppe Sollima.

Il paese passò verso la metà del sec. XVIII ad Alessandro Galletti e fu possesso di Giovanni Pietro II.

Presso il Palazzo Comunale sono visibili le iscrizioni in onore di Augusto e Tiberio e altre iscrizioni di età ellenistica.

Le attività economiche principali sono basate sull'agricoltura con la produzione di olive e fichidindia, e sui prodotti ittici con la pesca del pesce fresco. Ricordiamo soprattutto la Malvasia, tipico e gustoso vino locale.