Tra la Basilica e il Teatro, a monte del decumano, sorge l'edificio del Museo, restaurato e riordinato nel 2006. Dati storici e topografici relativi a Tindari; documentazione dello scavo e del restauro dei suoi monumenti, dal Settecento a oggi; grande plastico ricostruttivo della scena ellenistica del Teatro. Due Nikai in volo, costituendi forse i due acroteri di un tempio del sec. III-IV a.C., qui riportate (1965) dai Musei di Palermo e Siracusa; capitelli, basi, iscrizioni, mascherone teatrale tragico marmoreo, ecc. testa colossale di Augusto (dallo scavo della Basilica); statue onorarie romane di personaggi togati. Capitello fittile della casa C dell'insula romana. Nelle vetrine, ceramiche dal riempimento di cisterne di diverse età, dalle fognature della città, ecc. Materiali di un abitato dell'età del Bronzo, individuato sotto il tablinum e il peristillo della casa B; ceramiche e piccole terracotte di età ellenistica (interessanti alcune maschere teatrali e figure di attori di comemedia); urne cinerarie in piombo e vetro e corredi della necropoli ellenistica e romana.